Banco de Dados Biológicos
Banco de Dados Biológicos
O que é um banco de dados?
Um banco de dados na área da bioinformática é um sistema estruturado de armazenamento, organização e recuperação de informações relacionadas a dados biológicos, genômicos, proteômicos e outras informações relevantes para a pesquisa em biologia, medicina e áreas afins. Esses bancos de dados contêm uma vasta quantidade de informações que são cruciais para a pesquisa e análise de dados na área da saúde e biologia.
Armazenamento de Dados Abundantes: A bioinformática lida com grandes volumes de dados biológicos, como sequências de DNA, RNA, proteínas e informações clínicas. Bancos de dados são essenciais para armazenar esses dados de forma organizada e acessível.
Acesso Rápido: Bancos de dados permitem o acesso rápido e eficiente a informações valiosas, o que é vital para pesquisadores e profissionais de saúde.
Compartilhamento de Dados: Bancos de dados permitem que pesquisadores compartilhem seus dados com a comunidade científica, promovendo a colaboração e a reutilização de informações.
Consistência e Integridade dos Dados: Eles ajudam a manter a consistência e integridade dos dados, evitando erros de inserção e garantindo a precisão das informações.
Consultas e Análises Avançadas: Os bancos de dados permitem a realização de consultas complexas e análises de dados, o que é fundamental para a descoberta de padrões, relações e insights na área da saúde e biologia.
Metadados: Bancos de dados geralmente incluem metadados importantes que descrevem as informações, tornando mais fácil entender o contexto dos dados.
Suporte à Tomada de Decisão: Os dados armazenados em bancos de dados são frequentemente usados na tomada de decisões clínicas e na pesquisa, contribuindo para avanços no diagnóstico, tratamento e compreensão de doenças.
Tipos de Bancos de Dados
Na área da saúde e bioinformática, vários tipos de bancos de dados são usados para armazenar informações relevantes, e cada tipo tem seu propósito específico.
Bancos de Dados de Sequências Genômicas: Esses bancos de dados armazenam sequências de DNA e RNA de várias espécies, permitindo o acesso a genomas completos, exomas e outras informações genômicas.
Bancos de Dados de Proteínas: Contêm informações sobre sequências de proteínas, estruturas, funções e interações, facilitando a pesquisa sobre proteômica e bioquímica.
Bancos de Dados de Anotações Genômicas: Armazenam anotações funcionais e informações sobre genes, como locais de início e término, exons, introns e funções conhecidas.
Bancos de Dados Clínicos: São usados para registrar informações clínicas de pacientes, como históricos médicos, diagnósticos, tratamentos, resultados de exames e registros de saúde eletrônicos (EHRs).
Bancos de Dados de Expressão Gênica: Contêm dados de expressão gênica, incluindo informações de microarranjos e sequenciamento de RNA, para estudar padrões de expressão gênica em diferentes condições.
Bancos de Dados de Variantes Genéticas: Armazenam informações sobre variantes genéticas, como SNPs (polimorfismos de nucleotídeo único) e mutações, associadas a doenças genéticas e outras condições.
Bancos de Dados de Pathways e Redes Biológicas: Contêm informações sobre interações de proteínas, redes de pathways biológicos e vias de sinalização, auxiliando na compreensão de processos biológicos.
Bancos de Dados de Estruturas de Biomoléculas: São usados para armazenar informações sobre a estrutura tridimensional de proteínas, ácidos nucleicos e outros biomoléculas.
Bancos de Dados de Literatura Científica: Armazenam artigos científicos, publicações e informações bibliográficas relacionadas à saúde e bioinformática, facilitando a pesquisa de referências.
Bancos de Dados de Imagens Médicas: Contêm imagens médicas, como radiografias, ressonâncias magnéticas e tomografias computadorizadas, utilizadas em diagnósticos e pesquisa médica.
Bancos de Dados de Ontologias e Taxonomias: São usados para organizar e categorizar informações biológicas, tornando mais fácil a busca e a análise de dados.
Bancos de Dados de Metagenômica: Armazenam informações sobre comunidades microbianas complexas, permitindo a análise de ecossistemas microbianos.
Bancos de Dados de Farmacologia e Drogas: Contêm informações sobre drogas, interações medicamentosas, alvos farmacológicos e dados clínicos associados a medicamentos.
Bancos de Dados de Regulação Gênica: Armazenam informações sobre elementos regulatórios, promotores, enhancers e fatores de transcrição que controlam a expressão gênica.
Bancos de Dados de Epidemiologia: São usados para armazenar informações sobre doenças, surtos e dados epidemiológicos para monitorar e combater doenças.
Exemplos de Banco de Dados
Existem muitos bancos de dados na área da saúde e bioinformática, tanto abertos quanto fechados, que fornecem acesso a uma ampla variedade de informações biológicas e clínicas.
Bancos de Dados Abertos:
GenBank: Mantido pelo NCBI (National Center for Biotechnology Information), o GenBank contém sequências de DNA, RNA e proteínas de diversas fontes, incluindo genomas completos e sequências genéticas.
Ensembl: Uma base de dados de genomas e genes de várias espécies. Ela fornece anotações genômicas detalhadas, informações sobre variações genéticas e muito mais.
Uniprot: Uniprot é um repositório de informações sobre proteínas. Ele inclui sequências de proteínas, anotações funcionais, informações de localização celular e muito mais
dbSNP: Mantido pelo NCBI, o dbSNP é um banco de dados de polimorfismos de nucleotídeo único (SNPs) e variações genéticas em humanos e outras espécies.
The Cancer Genome Atlas (TCGA): TCGA contém dados genômicos e clínicos de diversos tipos de câncer. Esses dados são utilizados para pesquisa em oncologia.
Bancos de Dados Fechados (Requerem Acesso ou Pagamento):
UK BioBank: Um projeto de pesquisa biomédica no Reino Unido que coleta informações detalhadas de saúde, amostras biológicas e dados genéticos de mais de meio milhão de voluntários.
ClinicalTrials.gov: Um registro de ensaios clínicos em andamento e concluídos em todo o mundo.
DrugBank: Uma base de dados que fornece informações sobre medicamentos, suas propriedades e alvos moleculares.
OMIM (Online Mendelian Inheritance in Man): Uma base de dados que fornece informações sobre genes e distúrbios genéticos.
OMSB (Online Metabolic and Signaling Pathways): Uma fonte de informações sobre vias metabólicas e de sinalização.
Protein Data Bank (PDB): Um repositório de estruturas tridimensionais de proteínas, que requer acesso para baixar algumas estruturas detalhadas.
COSMIC (Catalogue Of Somatic Mutations In Cancer): Um banco de dados que contém informações sobre mutações somáticas em câncer.
